106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0868 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  100 
 
 		 217 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.89 
 
 		 212 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  51.39 
 
 		 218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  50.47 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.47 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  49.06 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  49.06 
 
 		 212 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  45.07 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  48.65 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  34.91 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  33.64 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.73 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  35.94 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 		 69 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.32 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  28.05 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.59 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.17 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.59 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  24.27 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  28.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  28.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  27.92 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  23.98 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.31 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  23.83 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  28.73 
 
 		 282 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.74 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  26.35 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  22.8 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.38 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  25.75 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  23.2 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  26.75 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  23.2 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.85 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.62 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  23.2 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  23.2 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  23.2 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  28.38 
 
 		 294 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.13 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.44 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  28.29 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.18 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.37 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.13 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  21.17 
 
 		 512 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.43 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  22.8 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  24.87 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  22.8 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.6 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 330 aa  45.4  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0917  hypothetical protein  31.94 
 
 		 339 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.178943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  23.67 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.54 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10701  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.21 
 
 		 333 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.638537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.89 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  23.38 
 
 		 207 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1016  hypothetical protein  25.21 
 
 		 339 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  27.71 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  30.95 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.26 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  23.87 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0018  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  26.89 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06381  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  25.6 
 
 		 328 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0655453  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2672  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 315 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340849 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.75 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.15 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  23.9 
 
 		 218 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  27.36 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.32 
 
 		 308 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.38 
 
 		 221 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 227 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.69 
 
 		 319 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 		 219 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>