115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1562 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  100 
 
 		 212 aa  303  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  99.32 
 
 		 212 aa  302  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  98.65 
 
 		 212 aa  301  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.5 
 
 		 211 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 		 212 aa  172  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  48.65 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.95 
 
 		 194 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  44.74 
 
 		 218 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  41.22 
 
 		 212 aa  114  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  40.82 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.41 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2319  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  97.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.227309  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  36.99 
 
 		 210 aa  84.7  5e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  36.81 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.2 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.19 
 
 		 321 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.61 
 
 		 308 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 309 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 327 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  28.22 
 
 		 257 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.95 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 		 212 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  25.47 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  27.61 
 
 		 206 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  26.99 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.19 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  22.16 
 
 		 294 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  26.11 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.53 
 
 		 294 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  26.11 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.11 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  25.61 
 
 		 216 aa  48.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  30.19 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.42 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  29.14 
 
 		 282 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 347 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.3 
 
 		 291 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.21 
 
 		 274 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 312 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  26.49 
 
 		 285 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  25.66 
 
 		 274 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 		 296 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  30.19 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3910  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 318 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.835741  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  24.85 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  25.32 
 
 		 281 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.71 
 
 		 213 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.95 
 
 		 290 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  27.63 
 
 		 293 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 		 278 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00691112  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  25.47 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  29.25 
 
 		 206 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0074  NmrA family protein  26.92 
 
 		 300 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  26.36 
 
 		 202 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 214 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 302 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  22.42 
 
 		 297 aa  43.9  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  31.13 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  31.13 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  31.13 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  25.93 
 
 		 291 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  25.95 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  31.13 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.22 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  29.82 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 291 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.09 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  24.16 
 
 		 434 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.16 
 
 		 324 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  23.64 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  23.6 
 
 		 275 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  25.31 
 
 		 276 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  25.29 
 
 		 282 aa  42.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  24.84 
 
 		 257 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  23.31 
 
 		 300 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 330 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  28.22 
 
 		 221 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.22 
 
 		 221 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  23.49 
 
 		 283 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  26.03 
 
 		 255 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>