67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7270 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  57.55 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  58.02 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  57.08 
 
 		 212 aa  257  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  50.47 
 
 		 217 aa  204  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  42.38 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  45.54 
 
 		 218 aa  181  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  58.5 
 
 		 158 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  38.68 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.61 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  31.58 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.22 
 
 		 69 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  30.77 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.02 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  26.89 
 
 		 282 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.83 
 
 		 295 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2319  hypothetical protein  52.17 
 
 		 60 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.227309  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.98 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  30.32 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  32.91 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  28.05 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  27.91 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.06 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  24.37 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  28.07 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.07 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.38 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.55 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.31 
 
 		 289 aa  45.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.257288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  28.95 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.86 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.81 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 350 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  27.37 
 
 		 605 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  26.81 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.5 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.91 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.86 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  25.77 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.51 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 324 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 342 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.1 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  24.75 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.53 
 
 		 294 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 		 230 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  32.14 
 
 		 202 aa  42  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.62 
 
 		 210 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  28.21 
 
 		 257 aa  42  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.12 
 
 		 293 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 		 327 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  32.43 
 
 		 287 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 324 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 218 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  34.29 
 
 		 273 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>