More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4033 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  81.75 
 
 		 287 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  81.75 
 
 		 287 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  81.85 
 
 		 287 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  80.42 
 
 		 287 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  80 
 
 		 287 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  73.01 
 
 		 289 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  70 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  69.64 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  57.44 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  55.75 
 
 		 289 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  53.29 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  49.32 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  51.4 
 
 		 292 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  33.33 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.54 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.69 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  37.02 
 
 		 584 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36.43 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.32 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  33.89 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  34.01 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  31.77 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.33 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  33.44 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  30.54 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  35.62 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.99 
 
 		 281 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  35.27 
 
 		 240 aa  99  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  31.06 
 
 		 273 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  31.74 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.21 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  36.4 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.51 
 
 		 288 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  30.66 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  35.78 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  36.07 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  31.76 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2191  NmrA family protein  35.34 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3410  NmrA family protein  30.95 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11403  normal  0.0133757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.31 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  32.43 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  31.85 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.09 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  89.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.53 
 
 		 434 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  31.25 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  29.15 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  32.54 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1765  NmrA-like  32.29 
 
 		 366 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0815614  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  40 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  30.45 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  34.32 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6482  NmrA family protein  33.91 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  31.35 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.18 
 
 		 271 aa  85.9  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.67 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.33 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.39 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  31.62 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  28.93 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.35 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03580  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0471673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  27.74 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.15 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  30.33 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  30.85 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.26 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  28.83 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  36 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  31.95 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1488  NmrA family protein  31 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  28.02 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  34.08 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  34.35 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  29.62 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  32.34 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  30 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.61 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.24 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  30.47 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0420  NmrA family protein  34.43 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  31.32 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4267  NmrA family protein  32.33 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.68 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  25.34 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  29.68 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  38.32 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  28.93 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  31 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  29.2 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  28.11 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  28.11 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>