198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2440 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 194 aa  394  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.24 
 
 		 212 aa  204  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  43 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  42.79 
 
 		 212 aa  164  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.5 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  42.79 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  41.79 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  41.38 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  38.24 
 
 		 218 aa  142  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  45.95 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.56 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  35.32 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  30.3 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  34.12 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  31.45 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  24.38 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  23.75 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.17 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  23.33 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.82 
 
 		 295 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  23.75 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.29 
 
 		 434 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  28.77 
 
 		 283 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 308 aa  53.1  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 308 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.4 
 
 		 283 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  29.91 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  29.91 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2375  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 338 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.61 
 
 		 281 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.61 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  28.77 
 
 		 290 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  26.47 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3579  hypothetical protein  53.57 
 
 		 88 aa  51.2  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 270 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.65 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.45 
 
 		 289 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  33.57 
 
 		 274 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  28.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.68 
 
 		 293 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  28.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  28.97 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  25.56 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  29.44 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.39 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  27.4 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.06 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17930  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.67 
 
 		 289 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.728869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  27.15 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  27.15 
 
 		 286 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  29.31 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 337 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.25 
 
 		 271 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  26.49 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  26.29 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  28.38 
 
 		 281 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  26.49 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  28.87 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  28.87 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  26.21 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  26.49 
 
 		 286 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  25.85 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  26.49 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  28.57 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  30.06 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  26.49 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  28.57 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  26.49 
 
 		 286 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  27.5 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  24.84 
 
 		 284 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  27.5 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.21 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  27.5 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  25.99 
 
 		 285 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.4 
 
 		 293 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  30.67 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  29.17 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.05 
 
 		 281 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>