133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1972 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  98.11 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  97.17 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  98.65 
 
 		 158 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.02 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.25 
 
 		 212 aa  251  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0868  saccharopine dehydrogenase related protein  49.06 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  46.51 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  43.87 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.79 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  37.56 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  94.03 
 
 		 69 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.9 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1649  saccharopine dehydrogenase or related protein  35.55 
 
 		 210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  35.55 
 
 		 205 aa  98.6  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2319  hypothetical protein  97.87 
 
 		 60 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.227309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.46 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.75 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  26.11 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  27.27 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.14 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  24.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  24.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  24.88 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  24.76 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  29.87 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.92 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.56 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.56 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.95 
 
 		 294 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.44 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 		 327 aa  52.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.229904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159089  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 308 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  26.28 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.12 
 
 		 293 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.77 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  28.93 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  25.62 
 
 		 289 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  22.75 
 
 		 294 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  25.93 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.09 
 
 		 290 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.64 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  25.32 
 
 		 434 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.18 
 
 		 291 aa  49.3  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  25.63 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.84 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  26.28 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.09 
 
 		 290 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  26.06 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 225 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  26.11 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.35 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  28.86 
 
 		 294 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  22.67 
 
 		 297 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  33.96 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.88 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  21.9 
 
 		 291 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.27 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 325 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  26.28 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 325 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 325 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  27.15 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  25.6 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  24.05 
 
 		 287 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  26.8 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  27.16 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  33.96 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  23.61 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 294 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 312 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  23.36 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  26.54 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  27.21 
 
 		 274 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.05 
 
 		 296 aa  45.1  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  25.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 347 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  26.36 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.03 
 
 		 281 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.3 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  22.34 
 
 		 281 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  27.78 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>