176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1434 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
223 aa  420  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
212 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
211 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  32.74 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  33.63 
 
 
211 aa  89  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.54 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  34.96 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  32.19 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  34.91 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  35.71 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  33.78 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  34.78 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  27.56 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  31.05 
 
 
282 aa  71.6  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  31.74 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.16 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.8 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  31.58 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  30.19 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  25.89 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.3 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1795  NmrA family protein  25.89 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
291 aa  62  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  23.79 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1538  NmrA family protein  25 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1972  NmrA family protein  25 
 
 
212 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.570171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
298 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  24.87 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.36 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  22.03 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  27.67 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  24.35 
 
 
206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
306 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.6 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  27.67 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.92 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
309 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  29.05 
 
 
297 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  21.13 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  24.2 
 
 
209 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  23.83 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.15 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.91 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  24.19 
 
 
282 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  31.28 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  32.93 
 
 
257 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.23 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
306 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  24.35 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  24.35 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  24.14 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  23.83 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  24.35 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  26.79 
 
 
207 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  21.93 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
217 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  26.47 
 
 
158 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  21.49 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  24.89 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
312 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  30.3 
 
 
218 aa  48.5  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
347 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  0.686614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
203 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  28.9 
 
 
283 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
309 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  32.94 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.44 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3686  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.65 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.38956  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1080  saccharopine dehydrogenase related protein  22.9 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  25.11 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  25.11 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  25.11 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.08 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 
295 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  23.08 
 
 
211 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.49 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.49 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.49 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191512  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>