76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3754 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.77 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.56 
 
 		 211 aa  130  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.05 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  29.91 
 
 		 282 aa  85.9  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.94 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  29.76 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.17 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.54 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  27.06 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.54 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  26.19 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  24.15 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  24.29 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  29.55 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  26.13 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  29.15 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  25.63 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.52 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.54 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.55 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.69 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  26.62 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  25.35 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  24.68 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  27.88 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  24.37 
 
 		 306 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44077  predicted protein  28.4 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  25.12 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.11 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  24.64 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  24.35 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25.64 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  25.14 
 
 		 304 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 		 304 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 		 304 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  23.47 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.03 
 
 		 270 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  25.79 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  24.06 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0754  hypothetical protein  23.56 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.15 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1014  hypothetical protein  24.87 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  28.77 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  22.44 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.16 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.64 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.16 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.16 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  28.77 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  23.15 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  27.27 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.15 
 
 		 291 aa  42  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.53 
 
 		 219 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.78 
 
 		 309 aa  42  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  27.54 
 
 		 276 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  25.13 
 
 		 257 aa  41.6  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>