More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1628 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.61 
 
 		 231 aa  286  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.17 
 
 		 231 aa  272  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  51.74 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.16 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  40.69 
 
 		 212 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  37.8 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  37.26 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  34.78 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  39.5 
 
 		 212 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  27.8 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  38.6 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  35.05 
 
 		 202 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  35.89 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  27.39 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  38.55 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  26.29 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.82 
 
 		 211 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  31.65 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.04 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.04 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.04 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.59 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  28.51 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  31.37 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  31.88 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  27.19 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  27.51 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.19 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.58 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  28.25 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  29.02 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.07 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  31.28 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.76 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.2 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  27.83 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  26.89 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.12 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.28 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  28.39 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  32.2 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  28.43 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 		 206 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  30.14 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  28.9 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  25.35 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  30.63 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  30.63 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  32.83 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  27.92 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  26.15 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  23.78 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  47.3 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0055  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  25.65 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  26.19 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.21 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  34.19 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.69 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  26.01 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  30.43 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  30.43 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  25.56 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.69 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  23.85 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  27.37 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.48 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  32.72 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  25.22 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.01 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  34.55 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.07 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>