More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23810 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  41.03 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  35.92 
 
 		 211 aa  121  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  37.26 
 
 		 231 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  37.8 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.3 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  37.19 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  33.98 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  35.38 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  31.25 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.27 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  30.38 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  33.52 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.46 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  24.63 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  27.33 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.09 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  29.76 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  31.86 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.59 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  31.37 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  28.12 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  31.63 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  31.88 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  27.5 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  27.5 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  27.5 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  27.5 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  31.88 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  28.22 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  24.29 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  24.76 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  25.93 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  24.55 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.12 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  28.48 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.75 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.97 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  24.64 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  25.87 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  23.81 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.55 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.09 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.37 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  31.4 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  29.11 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.04 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  29.73 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  27.35 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  26.99 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  28.43 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.5 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  30.91 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.312343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  35.51 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  24.51 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.16 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  33.33 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4540  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>