More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6521 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 210 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.58 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  32.31 
 
 		 215 aa  98.6  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.28 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  36.6 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.86 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  32.55 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  34.34 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.31 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  33.97 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  36.11 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  32.74 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  37.18 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  30.24 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  36.47 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  28.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  27.27 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  28.88 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  34.46 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  25.97 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  34.12 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  33.53 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.32 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  33.53 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  32.54 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  31.84 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  30.95 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  32.54 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  32.54 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  32.54 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  32.1 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.87 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.62 
 
 		 339 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  29.76 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  25.73 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  32.7 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.82 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  32.72 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  29.65 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  36.7 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.83 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.61 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.95 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  36.52 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.72 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  30.43 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  30.84 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  27.27 
 
 		 327 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.81 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  30.84 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.02 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  32.5 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  27.42 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  28.57 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  28.57 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1587  NmrA family protein  29.26 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428697  normal  0.242272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  28.64 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  27.95 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  32.64 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>