129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4907 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4907  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  394  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.233498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2134  hypothetical protein  59.59 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.27 
 
 		 210 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  38.4 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  44.68 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.21 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  47.3 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  31.51 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  40.51 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.66 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  29.76 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.77 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  39.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  30.59 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.23 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.36 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  35.11 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  26.19 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  28.37 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  35.25 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.62 
 
 		 227 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  34.04 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  26.51 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  34.94 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  22.43 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  34.94 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  28.03 
 
 		 327 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  34.94 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  36.26 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  38.36 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  36.26 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  36.14 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  36.14 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  36.14 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.47 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  30.69 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  36.14 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08060  oxidoreductase CipA-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01630)  34.25 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.19032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  41.43 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  35.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  35.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  35.16 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  35.16 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  36.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  29.35 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  31.4 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0487  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 		 305 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00126012  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.16 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  36.99 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  35.16 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  35.06 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.95 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  30.61 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  33.6 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  32.38 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 327 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2017  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  30.91 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000204131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1459  domain of unknown function DUF1731  38.36 
 
 		 318 aa  44.7  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.812014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  37.68 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  21.84 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.07 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  28.83 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.13 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  40.58 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1152  NmrA-like  38.57 
 
 		 510 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  44.19 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  30.23 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  33.94 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>