239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3221 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.38 
 
 		 210 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  82.38 
 
 		 210 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  81.43 
 
 		 210 aa  351  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.95 
 
 		 210 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80 
 
 		 210 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  78.57 
 
 		 210 aa  338  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  79.52 
 
 		 210 aa  324  7e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.08 
 
 		 212 aa  297  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  66.05 
 
 		 215 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  61.79 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.93 
 
 		 210 aa  259  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.56 
 
 		 213 aa  255  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  47.66 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.26 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  46.26 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  43.72 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  45.54 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.87 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.53 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  44.7 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  44.39 
 
 		 211 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  45.07 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.86 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  42.65 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.18 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  43.87 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.92 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.26 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.18 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.92 
 
 		 200 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.99 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  42.52 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  44.08 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  39.05 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.6 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  40.09 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  41.51 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  41.78 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  40.28 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.72 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.13 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4751  hypothetical protein  41.86 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  37.04 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  41.47 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  40.28 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  39.81 
 
 		 212 aa  131  9e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  44.08 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  44.86 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  44.86 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  42.65 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  38.14 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  37.44 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.39 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  39.72 
 
 		 203 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  44.39 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  35.81 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  44.39 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  44.39 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.18 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  44.39 
 
 		 240 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.43 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  41.43 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  37.45 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  38.86 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.23 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  39.05 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  38.03 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.55 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  37.26 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  35.21 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3261  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.85 
 
 		 213 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3985  hypothetical protein  35.81 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  34.29 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.32 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  35.78 
 
 		 207 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>