More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1033 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  100 
 
 		 204 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.16 
 
 		 204 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  93.14 
 
 		 204 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  90.69 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.63 
 
 		 205 aa  300  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.55 
 
 		 204 aa  294  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.9 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2074  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  59.41 
 
 		 203 aa  238  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0828114  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.39 
 
 		 203 aa  228  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4232  hypothetical protein  56.37 
 
 		 203 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1454  NmrA family protein  57.35 
 
 		 203 aa  226  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2522  hypothetical protein  54.73 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  61.88 
 
 		 203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.96 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  56.44 
 
 		 202 aa  208  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5517  hypothetical protein  52.48 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.48 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  48.58 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  47.64 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.64 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  47.03 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 		 214 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.22 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.19 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4887  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5202  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  164  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00721311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3643  hypothetical protein  41.63 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000188612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5218  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000358421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4769  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.03269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5170  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7194299999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0041  hypothetical protein  43.06 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000214852  hitchhiker  2.07988e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5207  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000123612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4789  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000718942  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.39 
 
 		 213 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4926  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000966245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5302  hypothetical protein  42.58 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.98 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.02 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.02 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.08 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0420481  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.65 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  45 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  43.54 
 
 		 211 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.13 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1755  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  42.18 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  43.52 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.71 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.18 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 		 213 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00403103  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0768  putative NADH-flavin reductase  42.18 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  44.44 
 
 		 213 aa  141  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.15 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000014764  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.11 
 
 		 213 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.427063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.15 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26050  putative NADH-flavin reductase  40.65 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.600707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7867  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.13 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2862  putative NADH-flavin reductase protein  42.38 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.45 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0670  hypothetical protein  35.55 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.84049e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.67 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0802  hypothetical protein  39.63 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.971271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  40.29 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  38.81 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1266  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0147232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2861  hypothetical protein  43.06 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2892  putative NADH-flavin reductase  35.81 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  40.19 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3985  hypothetical protein  38.14 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  39.25 
 
 		 206 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  39.23 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1506  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.11 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.15916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1377  hypothetical protein  42.11 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.753826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4751  hypothetical protein  38.14 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 227 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  37.21 
 
 		 217 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  35.98 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1088  hypothetical protein  35.16 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.775201 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1783  hypothetical protein  41.63 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0359624  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0694  hypothetical protein  41.63 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00014158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0458  hypothetical protein  41.63 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1176  hypothetical protein  41.63 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.335392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1373  hypothetical protein  41.63 
 
 		 240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0976  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.803978  decreased coverage  0.00042868 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.328892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3367  NmrA family protein  36.79 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.670735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>