255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2120 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  100 
 
 		 209 aa  403  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  48.82 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.5 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  42.25 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  41.31 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  37.98 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  35.38 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  38.6 
 
 		 231 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 		 231 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.56 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  38.5 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  25.96 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  23.19 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.3 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.32 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  23.33 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.96 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  25.96 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  25.48 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.96 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25.96 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  25.48 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  24.66 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  22.86 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  26.54 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  22.38 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.7 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  27.4 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  30.19 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.49 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  25.84 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0187  hypothetical protein  28.84 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  30.56 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  23.81 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.9 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.35 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0642  NmrA family protein  34.27 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0621  NmrA family protein  34.27 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.837507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  32.26 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  29.15 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  29.33 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  29.63 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  28.44 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  32.56 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  24.35 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  27.49 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1002  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0517555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  32.08 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  26.42 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.58 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  32.73 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  35.4 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  33.18 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1801  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  27.65 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4261  hypothetical protein  31.9 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  0.186393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  26.79 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4152  hypothetical protein  31.05 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  27.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0824  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  32.2 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  25.12 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.69 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  27.71 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8730  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase protein  28.3 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.12 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0220  hypothetical protein  30.5 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000163104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>