163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42659 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  100 
 
 
282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
212 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.64 
 
 
205 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
211 aa  99.4  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  32.56 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
209 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  33.19 
 
 
209 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  27.6 
 
 
223 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  29.91 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  32.26 
 
 
211 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  32.55 
 
 
212 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.16 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  30.94 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  34.2 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.77 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  31.88 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  31.07 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.74 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0679253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.91 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
223 aa  72  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  33.99 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.96 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  25.17 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  25.93 
 
 
211 aa  67  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  28.04 
 
 
219 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  25.58 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  28.44 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  22.81 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
227 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  26.11 
 
 
211 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.18 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 
212 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  28.76 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  27.96 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  29.72 
 
 
209 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  29.17 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.42 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.88 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  30.62 
 
 
223 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.93 
 
 
224 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.2 
 
 
223 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
213 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
212 aa  59.7  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  27.83 
 
 
227 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36435  predicted protein  26.03 
 
 
247 aa  58.9  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.11 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.73 
 
 
211 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  25.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  26.34 
 
 
210 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  25.66 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  26.67 
 
 
219 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.52 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.64 
 
 
223 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  28 
 
 
211 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  30.57 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  30.57 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  30.57 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  35.14 
 
 
216 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.83 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  29.03 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.57 
 
 
222 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  23.72 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
211 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
231 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
227 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  26.96 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.73 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  27.45 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.13 
 
 
217 aa  52.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  27.88 
 
 
212 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  26.67 
 
 
215 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  24.79 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
211 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  29.67 
 
 
338 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  25.11 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  32.5 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.71 
 
 
212 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  28.84 
 
 
224 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.23 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  24.66 
 
 
211 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  24.66 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  24.66 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  24.66 
 
 
211 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>