227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2144 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.22 
 
 
228 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  49.52 
 
 
210 aa  197  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  48.34 
 
 
267 aa  174  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  38.46 
 
 
210 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4454  hypothetical protein  33.97 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.14 
 
 
227 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  35.92 
 
 
207 aa  111  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36.28 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  35.44 
 
 
207 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  36.04 
 
 
224 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  39.47 
 
 
216 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  39.47 
 
 
216 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  39.47 
 
 
216 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.48 
 
 
229 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
219 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.48 
 
 
223 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  33.66 
 
 
209 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
219 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  38.13 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  31.73 
 
 
221 aa  94  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  32.38 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.74 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
209 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.28 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  29.95 
 
 
291 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.9 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.96 
 
 
321 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  29.33 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  34.05 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1217  NmrA family protein  29.44 
 
 
343 aa  77  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000104302  decreased coverage  0.000138071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.9 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1163  NmrA family protein  28.14 
 
 
340 aa  75.1  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00319088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.27 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.15 
 
 
205 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1379  NmrA family protein  29.49 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.77544  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.24 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.93 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  30.09 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  29.49 
 
 
232 aa  72  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.09 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  34.42 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  31.63 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0471  hypothetical protein  27.31 
 
 
341 aa  67  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120247  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2842  hypothetical protein  27.83 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.81 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  30.43 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  25.71 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  33.02 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 
232 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  28.71 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  35.07 
 
 
493 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  28.5 
 
 
219 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  28.71 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 
236 aa  62.4  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  29.09 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  30.73 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 
320 aa  62  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  30.05 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  29.27 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  29.3 
 
 
227 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  33.94 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  26.82 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1679  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.05 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.165214  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  34.35 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6307  NmrA family protein  30.59 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.378385  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1059  hypothetical protein  27.54 
 
 
332 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.83 
 
 
257 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  36.44 
 
 
294 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  33.59 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.08 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  29.08 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  29.08 
 
 
209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  26.51 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  34.17 
 
 
228 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.56 
 
 
327 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0384  hypothetical protein  27.2 
 
 
291 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  28.86 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
238 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  32.86 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.17 
 
 
332 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>