More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1729 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  70.69 
 
 		 233 aa  322  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.41 
 
 		 232 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.16 
 
 		 233 aa  318  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.09 
 
 		 232 aa  314  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  62.22 
 
 		 231 aa  297  8e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  63.11 
 
 		 232 aa  297  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.66 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  48.44 
 
 		 231 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.37 
 
 		 231 aa  205  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  46.49 
 
 		 231 aa  204  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.34 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.72 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.9 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 227 aa  145  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.76 
 
 		 209 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.76 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  34.39 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  38.46 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  34.02 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  32.41 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  33 
 
 		 366 aa  99  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  30.94 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  30.41 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  31.48 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.07 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  33.33 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  33.33 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  33.62 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  30.33 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 		 212 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  30.48 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  31.9 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  39.06 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  29.73 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.51 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  32.63 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.15 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  29.28 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  33.04 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  29.28 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  31.17 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  33.18 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  33.02 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  29.05 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  31.6 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  29.34 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.96 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.03 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  30.84 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  25.7 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  30.14 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.83 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  29.54 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.7 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  32.76 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.73 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.36 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  28.31 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  42.34 
 
 		 500 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  30.89 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.65 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.65 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  24.77 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  32.14 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.05 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  24.66 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  28.18 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.19 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.85 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  26.05 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.73 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  24.19 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2445  NmrA family protein  30.91 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.385594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.46 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.46 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  27.88 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>