238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1314 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.26 
 
 		 238 aa  334  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  67.54 
 
 		 231 aa  330  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.3 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.3 
 
 		 231 aa  328  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.37 
 
 		 235 aa  328  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  58.01 
 
 		 231 aa  260  2e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  44 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  45.37 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  41.92 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  42.67 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 		 227 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.23 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  34.23 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  38.03 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  33.33 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  33.48 
 
 		 366 aa  98.6  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.47 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  31.43 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.2 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.2 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  41.73 
 
 		 126 aa  89.4  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  29.33 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  29.65 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.32 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  29.15 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.96 
 
 		 328 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  33.05 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.17 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  35.5 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.49 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  32.3 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0675  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.09 
 
 		 320 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240438  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  26.83 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  30.88 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  29.61 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  27.75 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.96 
 
 		 494 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  28.57 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  28.57 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.27 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  30.52 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.06 
 
 		 339 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  27.27 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  30.88 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  28.5 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  28.7 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.63 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  29.49 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.7 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.95 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.03 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  29.66 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  28.97 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  30.86 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.48 
 
 		 494 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.15 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1250  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.78 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.263784  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  36.59 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  39.82 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  28.76 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13281  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.425658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13181  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.974044  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  28.45 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  27.22 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  26.44 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13431  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  29.85 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  40.35 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.54 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.13 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  28.64 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08511  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.07 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0761  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.78 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16011  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.31 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.975575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  27.88 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.61 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6101  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189492  normal  0.808784 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.61 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  27.78 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12271  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.09 
 
 		 320 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0616034  normal  0.226858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.51 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>