179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_10747 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  53.33 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 		 219 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 		 209 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.08 
 
 		 218 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  35.81 
 
 		 209 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.12 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  34.82 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  34.47 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  33.05 
 
 		 219 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  34.82 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  31.91 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.77 
 
 		 233 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  35.74 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.82 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  33.33 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  32.47 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33.62 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  33.19 
 
 		 231 aa  85.5  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 		 232 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  32.91 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  33.2 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  31.15 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  32.05 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.19 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  30.86 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  32.46 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  33.04 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  31.6 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  30.17 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  31.28 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  29.33 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  41.49 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.42 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  30.16 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  36.81 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.78 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  30.26 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.78 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  72  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  30.36 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.96 
 
 		 491 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  31.72 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  36.36 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.96 
 
 		 491 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  33.7 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  29.39 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.42 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  33.15 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.78 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  29.39 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.63 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  40 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.46 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  28.76 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  29.26 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  35.42 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  29.15 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  26.75 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  26.75 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  27.39 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  27.92 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.06 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.35 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  31.21 
 
 		 285 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  30.86 
 
 		 285 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.49 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.61 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  29.21 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  34.45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  34.45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  34.45 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  29.61 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  35.29 
 
 		 209 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  29.83 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>