119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42483 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  100 
 
 		 386 aa  793    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43235  predicted protein  30.53 
 
 		 618 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  30.34 
 
 		 334 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  29.47 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.25 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.79 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  25.11 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.2 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.33 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  23.66 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  27.47 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  28.27 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  27.35 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  28.51 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 236 aa  55.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  29.15 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  45.9 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.41 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.41 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  23.75 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  50.82 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  27.87 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  27.87 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 238 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  49.18 
 
 		 491 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  28.07 
 
 		 233 aa  53.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 233 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  26.6 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  27.35 
 
 		 231 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.93 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  28.88 
 
 		 232 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  28.72 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35 
 
 		 500 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 		 222 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.12 
 
 		 214 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.11 
 
 		 219 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  23.11 
 
 		 215 aa  49.7  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  26.4 
 
 		 227 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 225 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  40 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  24.21 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.51 
 
 		 212 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  23.98 
 
 		 222 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  29.26 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.94 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2598  hypothetical protein  24.75 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2652  hypothetical protein  24.75 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  26.79 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  24.56 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.19 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  38.24 
 
 		 273 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  22.22 
 
 		 214 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 240 aa  47.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.706797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  25.53 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.16 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  20.93 
 
 		 206 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  34.12 
 
 		 279 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3916  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.42 
 
 		 218 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  27.27 
 
 		 284 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  26.59 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 		 234 aa  46.6  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.54 
 
 		 295 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0799  hypothetical protein  36.59 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  31.71 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 		 231 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  23.56 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  25.12 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  31.71 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  28.05 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0390  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.53 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  57.5 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  41.94 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  22.67 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  46.67 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  26.13 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  25 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  26.13 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  28.47 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  36.11 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  26.77 
 
 		 228 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.83 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.67 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.665439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  26.84 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  39.71 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  26.47 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3376  NmrA family protein  31.96 
 
 		 513 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388935  normal  0.205054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  32.93 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.8 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>