299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0258 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.39 
 
 		 232 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.09 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  68.83 
 
 		 232 aa  322  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  69.16 
 
 		 232 aa  318  6e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  65.67 
 
 		 231 aa  309  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  69.1 
 
 		 233 aa  305  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.43 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.12 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  45.26 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  46.09 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.4 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.34 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  38.25 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.78 
 
 		 227 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  38.68 
 
 		 209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  39.81 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  29.72 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  30.84 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  30.17 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  32.02 
 
 		 366 aa  96.7  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  30.19 
 
 		 219 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 212 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  37.77 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  32.49 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  44.8 
 
 		 126 aa  91.7  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 		 213 aa  91.7  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  29.72 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.79 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 272 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  32.26 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  33.49 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  34.98 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.64 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  28.31 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  31.63 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.85 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  33.12 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.35 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  31.4 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.18 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12408  predicted protein  33.52 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00187836  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  30.58 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  31.65 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.14 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.65 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  29.19 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.05 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  33.18 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5106  NmrA family protein  29.86 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.920576  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  32.58 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  30.88 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  31.65 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.65 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  26.89 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  32.88 
 
 		 257 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.470267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  27.85 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.45 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  23.7 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  28.27 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.96 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  27.14 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.14 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01819  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.520002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  32.51 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0253949  normal  0.427643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  34.56 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.64 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0529  NmrA family protein  31.74 
 
 		 304 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.616457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  28.11 
 
 		 223 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  28.99 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0242  saccharopine dehydrogenase related protein  23.35 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1032  NmrA family protein  40.51 
 
 		 296 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.07 
 
 		 494 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2075  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35 
 
 		 366 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0864456  normal  0.131531 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  25.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  26.07 
 
 		 386 aa  53.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  31.1 
 
 		 297 aa  52.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3162  NmrA-like  25 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.186566  hitchhiker  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  28.19 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  40 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.61 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>