187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3457 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  100 
 
 
500 aa  1018    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  57.34 
 
 
493 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  58.66 
 
 
494 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  56.36 
 
 
491 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  56.16 
 
 
491 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  55.13 
 
 
494 aa  548  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  52.6 
 
 
500 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  26.98 
 
 
486 aa  126  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  42.13 
 
 
174 aa  126  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.11 
 
 
169 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.68 
 
 
170 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.43 
 
 
172 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  33.16 
 
 
187 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  42.07 
 
 
179 aa  110  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.33 
 
 
188 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  34.68 
 
 
181 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.88 
 
 
176 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  36.31 
 
 
193 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  36.31 
 
 
191 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  33.7 
 
 
212 aa  99.8  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  35.76 
 
 
182 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  34.13 
 
 
182 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  34.55 
 
 
182 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  37.78 
 
 
161 aa  87.8  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46720  predicted protein  28.48 
 
 
795 aa  87.4  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  31.91 
 
 
186 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  34.73 
 
 
182 aa  86.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49580  predicted protein  32.28 
 
 
247 aa  86.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  31.41 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  31.61 
 
 
186 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 
272 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  31.03 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  30.64 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  30.3 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.57 
 
 
169 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  37.98 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  35.96 
 
 
126 aa  73.6  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.81 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  34.5 
 
 
216 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  35.71 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  29.44 
 
 
166 aa  64.7  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
236 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.64 
 
 
231 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
238 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  46.05 
 
 
257 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.25 
 
 
195 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  36.72 
 
 
231 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.17 
 
 
178 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  31.91 
 
 
174 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  33.33 
 
 
257 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  35.86 
 
 
174 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  29.8 
 
 
201 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  36.3 
 
 
231 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  33.13 
 
 
257 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  33.13 
 
 
257 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.84 
 
 
180 aa  60.5  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  34.48 
 
 
174 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  34.17 
 
 
209 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  31.41 
 
 
257 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.33 
 
 
218 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  36.57 
 
 
233 aa  59.7  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  33.79 
 
 
174 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
219 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.6 
 
 
235 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  35.88 
 
 
231 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
209 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  34.55 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  36.94 
 
 
173 aa  58.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 
232 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.88 
 
 
482 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.98 
 
 
232 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.72 
 
 
178 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.72 
 
 
178 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7062  NmrA family protein  46.27 
 
 
512 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.03 
 
 
178 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
219 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  36.5 
 
 
232 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29379  predicted protein  34.94 
 
 
262 aa  57  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.146884  normal  0.825443 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  28.24 
 
 
175 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  37.8 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  35.42 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
233 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
270 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.72 
 
 
174 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44936  predicted protein  25.84 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  47.54 
 
 
240 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  36.8 
 
 
232 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  28.57 
 
 
216 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17427  predicted protein  31.33 
 
 
312 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  22.26 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  22.26 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  41.56 
 
 
314 aa  53.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.84 
 
 
328 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.76 
 
 
176 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
338 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  43.86 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  30.43 
 
 
221 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.07 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>