42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0474 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  353  7.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  47.26 
 
 
180 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  43.24 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  44 
 
 
162 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  39.74 
 
 
168 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1273  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.75 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.51 
 
 
162 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.41 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.69 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.64 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  35.77 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  33.79 
 
 
493 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.76 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  33.96 
 
 
287 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.64 
 
 
172 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  32.61 
 
 
166 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  35.29 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  36.69 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  36.28 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  36.94 
 
 
500 aa  58.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.48 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.37 
 
 
500 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.54 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.51 
 
 
494 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  31.61 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  31.06 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  32.38 
 
 
201 aa  51.2  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.17 
 
 
178 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  31.47 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.52 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.52 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.38 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.36 
 
 
195 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.03 
 
 
491 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.03 
 
 
491 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.87 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  30.07 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  33.81 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  27.21 
 
 
175 aa  44.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  28.45 
 
 
199 aa  44.3  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>