24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1273 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1273  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  100 
 
 		 180 aa  364  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  41.22 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  40.67 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.42 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  37.33 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  38.51 
 
 		 162 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  37.75 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.67 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  34 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  34 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  28.74 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  32.53 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.72 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.97 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  30.26 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.19 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.19 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.19 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.52 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.48 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  26.72 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  23.68 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 		 170 aa  40.8  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>