56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2814 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  99.44 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  98.88 
 
 
178 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  98.28 
 
 
174 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  78.65 
 
 
178 aa  297  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  76.44 
 
 
174 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  77.01 
 
 
174 aa  283  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  75.29 
 
 
174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  74.14 
 
 
174 aa  278  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  44.25 
 
 
167 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  34.16 
 
 
187 aa  101  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  35.59 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.11 
 
 
170 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.16 
 
 
169 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.81 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  34.12 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  31.68 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.68 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.68 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  33.73 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.02 
 
 
494 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.91 
 
 
500 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.07 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.82 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 
494 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  25.88 
 
 
175 aa  60.8  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  31.36 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  34.72 
 
 
500 aa  57.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  42.7 
 
 
491 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  42.7 
 
 
491 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  29.48 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  27.13 
 
 
493 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  30.56 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  30.16 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  29.66 
 
 
186 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  27.88 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  27.44 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  28.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  29.03 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  28.89 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.92 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  29.2 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  27.68 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.45 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  30.52 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1273  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.19 
 
 
180 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.97 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  29.93 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  27.86 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  28.24 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  27.48 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  29.2 
 
 
182 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  23.03 
 
 
287 aa  41.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>