46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2199 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  44.83 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  44.25 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  44.25 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  43.68 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  140  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  43.68 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  43.1 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  41.38 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.62 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  31.71 
 
 		 174 aa  84  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.55 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.77 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  30.26 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  32.52 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.37 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.41 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  31.9 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  31.71 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.93 
 
 		 494 aa  62  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  28.66 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.11 
 
 		 500 aa  61.6  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  35.17 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  31.54 
 
 		 493 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  32.54 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.99 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.38 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.65 
 
 		 494 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.89 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  25.45 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.58 
 
 		 491 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  29.27 
 
 		 500 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.58 
 
 		 491 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  26.38 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  26.59 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  28 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.74 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  26.59 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  25.56 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1648  hypothetical protein  24.03 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  24.71 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  25.71 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  28.22 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  34.67 
 
 		 186 aa  42  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>