44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0513 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  39.24 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  33.96 
 
 		 201 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.62 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  35.81 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.51 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.18 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  34.73 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.94 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  34.94 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.73 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  31.52 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.48 
 
 		 176 aa  84.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.25 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.45 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  30.3 
 
 		 493 aa  75.1  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.85 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.4 
 
 		 491 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  29.44 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.01 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.4 
 
 		 491 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  32.61 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.87 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.78 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.68 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.68 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.12 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  25.45 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  25.43 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  24.56 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  24.56 
 
 		 174 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.53 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  28.16 
 
 		 216 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.01 
 
 		 178 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.16 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  28.91 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  30.71 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  23.86 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.82 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  27.66 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>