54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3121 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  88.51 
 
 		 178 aa  326  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  86.21 
 
 		 174 aa  313  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  84.48 
 
 		 174 aa  308  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  84.48 
 
 		 174 aa  308  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  74.71 
 
 		 178 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  74.14 
 
 		 178 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  74.14 
 
 		 174 aa  276  8e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  72.99 
 
 		 178 aa  274  4e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  41.38 
 
 		 167 aa  130  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  35.8 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  36.47 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  37.21 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.74 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.54 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  34.57 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.92 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.95 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.43 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  31.82 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  35.85 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  32.16 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.32 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.45 
 
 		 491 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.45 
 
 		 491 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.34 
 
 		 494 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.99 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  29.79 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.48 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  33.79 
 
 		 500 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  26.99 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.98 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  25.99 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  25.73 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1273  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.26 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  26.28 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  26.59 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  28.42 
 
 		 272 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  27.61 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  27.81 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  24.83 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  25.35 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  27.16 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47097  predicted protein  25.71 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.71 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  28.75 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  23.86 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1689  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.54 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.82 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  30.53 
 
 		 216 aa  42  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  26.98 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>