45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2349 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  45.58 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  45.21 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  41.72 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  40.65 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  37.74 
 
 		 179 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  42.95 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.6 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  35.81 
 
 		 166 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  38.22 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  38.62 
 
 		 201 aa  103  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.58 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.97 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  35.54 
 
 		 188 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  39.07 
 
 		 174 aa  94.4  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  37.04 
 
 		 493 aa  87.8  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  37.78 
 
 		 500 aa  87.8  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  40.34 
 
 		 494 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.59 
 
 		 494 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.21 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.94 
 
 		 195 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.29 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.29 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.95 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  35.85 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.38 
 
 		 500 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  32.1 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  31.48 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  30.68 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  28.66 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  35.4 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.3 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 		 272 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  31.47 
 
 		 173 aa  50.8  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  29.49 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  26.83 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4021  hypothetical protein  32.97 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.986867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  23.3 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  28.67 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  22.73 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  31.51 
 
 		 191 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>