45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2110 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  45.58 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  38.93 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  40.13 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.95 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.89 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  35.62 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.82 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.31 
 
 		 176 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  30.38 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  36.13 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  33.76 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.19 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  32.48 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.12 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  31.13 
 
 		 493 aa  85.1  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.28 
 
 		 494 aa  75.1  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  28.57 
 
 		 500 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.9 
 
 		 500 aa  74.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.11 
 
 		 494 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.29 
 
 		 195 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.77 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.3 
 
 		 491 aa  67.8  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.3 
 
 		 491 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.65 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.07 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.07 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.06 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  28.82 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  28.24 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  28.82 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  28.99 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  28.79 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  26.99 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  28.93 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  24.09 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  26.83 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  26.56 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  23.53 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  32.5 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  27.73 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  24.14 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  26.99 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52100  possible complex I intermediate associated protein  22.62 
 
 		 262 aa  41.6  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>