46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3246 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  38.62 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  33.96 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1666  hypothetical protein  34.81 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2110  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.13 
 
 		 169 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.484731  normal  0.386496 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2258  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  41.1 
 
 		 176 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  36.73 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.12 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  32.93 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.07 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.94 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  35.22 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  32.32 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  30.82 
 
 		 176 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1723  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.12 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.14 
 
 		 494 aa  82  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.95 
 
 		 494 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  32.62 
 
 		 493 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  32.16 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.58 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.58 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  29.8 
 
 		 500 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  31.4 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  28.48 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1439  hypothetical protein  30.99 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.48 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  30.41 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  30.41 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.48 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.48 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.48 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  30.66 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0474  hypothetical protein  32.38 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  29.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2199  hypothetical protein  28.22 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.567455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1412  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.94 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  30.84 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1246  hypothetical protein  30.97 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000296888 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  25.76 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  30.67 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  28.66 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3775  hypothetical protein  31.63 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0750974  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  26.09 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3798  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.98 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  0.343807 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  26.51 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>