98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42835 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  100 
 
 
372 aa  757    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  38.26 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.66 
 
 
494 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  30.86 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.69 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  39.69 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  37.98 
 
 
500 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  29.34 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  41.18 
 
 
493 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  31.95 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.06 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.54 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  28.52 
 
 
282 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
231 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  30.86 
 
 
231 aa  67  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
232 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
270 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  26.88 
 
 
257 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  27.61 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
235 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  30.89 
 
 
232 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  25.91 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  27.82 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
219 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17611  putative NADH-flavin reductase  28.11 
 
 
227 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  30.65 
 
 
233 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  30.49 
 
 
231 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.89 
 
 
218 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
211 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
227 aa  59.7  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 
211 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09591  putative NADH-flavin reductase  27.13 
 
 
221 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.5 
 
 
212 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
233 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
232 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  27.49 
 
 
221 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.95 
 
 
293 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  26.64 
 
 
219 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  29.38 
 
 
308 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
272 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0100166 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7116  predicted protein  28.51 
 
 
218 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150512  normal  0.0561113 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  26.33 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35627  predicted protein  26.98 
 
 
345 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0500584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  30.6 
 
 
209 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
209 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
223 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  25.82 
 
 
219 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  24.38 
 
 
212 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
211 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25.82 
 
 
219 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  26.51 
 
 
219 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  28.02 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.02 
 
 
257 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  30.99 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
211 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
213 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  28.09 
 
 
212 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 
219 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0209  putative NADH-flavin reductase  25.48 
 
 
222 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  28.45 
 
 
209 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.72 
 
 
285 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.32 
 
 
503 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3236  NmrA family protein  23.98 
 
 
257 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.73 
 
 
222 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7335  predicted protein  33.33 
 
 
126 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.772508  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
214 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  29.41 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.31 
 
 
211 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  41.18 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  23.83 
 
 
283 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.18 
 
 
223 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2016  NmrA family protein  25.63 
 
 
339 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.675517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.42 
 
 
231 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.8 
 
 
876 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0956  hypothetical protein  27.17 
 
 
224 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.652455  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  29.32 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18769  predicted protein  27.17 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032519  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1559  predicted protein  36.99 
 
 
486 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
228 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  25.31 
 
 
223 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  22.73 
 
 
334 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3741  hypothetical protein  28.12 
 
 
470 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
212 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
295 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  23.46 
 
 
304 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43235  predicted protein  52.38 
 
 
618 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.55 
 
 
217 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3118  NmrA family protein  29.41 
 
 
289 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
225 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  26.58 
 
 
209 aa  42.7  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  37.68 
 
 
282 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0008  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
311 aa  42.7  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.97826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>