114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45185 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  100 
 
 		 304 aa  625  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0799  hypothetical protein  41.63 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2520  hypothetical protein  39.67 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.706797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1440  hypothetical protein  38.22 
 
 		 158 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3897  NmrA-like  34.01 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  27.35 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  28.86 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  27.6 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1016  hypothetical protein  26.72 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.861732  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  26.25 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  27.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  31.88 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.93 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 		 231 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  26.7 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1297  NmrA family protein  41.94 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000203122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  25.21 
 
 		 231 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  25.81 
 
 		 209 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  62.5 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2018  hypothetical protein  34.18 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.810011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.11 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  28.14 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  36.71 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  27.93 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.56 
 
 		 216 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  22.91 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1242  NmrA family protein  41.57 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1372  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0745309  normal  0.267287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1422  NmrA family protein  36.71 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.578575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1606  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 482 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42835  predicted protein  24.18 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1448  hypothetical protein  26.24 
 
 		 209 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  40.24 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  25.93 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  36.59 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  26.37 
 
 		 206 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1875  hypothetical protein  23.61 
 
 		 218 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36590  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.78 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  25.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0020  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.77 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000112867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 349 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000791042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2237  NmrA family protein  32.91 
 
 		 305 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49437  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases-like protein  26.94 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  26.2 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  21.51 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  21.51 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  21.51 
 
 		 211 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  25.87 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  22.11 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  22.11 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  25.87 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  25 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.55 
 
 		 231 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.21 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1956  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000864089  hitchhiker  0.00126231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3261  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.36 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  25 
 
 		 207 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  25.18 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  36.71 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  27.15 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  27.05 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  33.62 
 
 		 500 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  23.63 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0144299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07801  putative NADH-flavin reductase  23.79 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.368016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3443  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.36 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0794  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  26.67 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3715  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.26 
 
 		 223 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  22.32 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.88 
 
 		 326 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24256  predicted protein  27.23 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0148146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  27.98 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  21.58 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.5 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.04 
 
 		 680 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2076  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.56 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.106367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02852  conserved hypothetical protein  25.58 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000137618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  36.36 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.23 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4180  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.58 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02802  hypothetical protein  25.58 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000121739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>