53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2520 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2520  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.706797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0799  hypothetical protein  52.07 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1440  hypothetical protein  54.9 
 
 		 158 aa  185  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0173635  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45185  predicted protein  39.67 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  30.38 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  27.8 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  23.14 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.83 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.87 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 		 876 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0227  NmrA family protein  27.27 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  29.31 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0749  putative NADH-flavin reductase  35.94 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42483  predicted protein  35.29 
 
 		 386 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0692155  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  36.25 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  33.66 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.89 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 		 530 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 		 329 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.56 
 
 		 231 aa  45.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2604  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  28.81 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.56 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  32.71 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  37.18 
 
 		 500 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  37.8 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0060  hypothetical protein  39.76 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.1 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1232  NmrA family protein  35.71 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000395859  normal  0.0148086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.52 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.16 
 
 		 314 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2766  NmrA family protein  40.54 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.814465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.39 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  22.13 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 308 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0343  NADH-ubiquinone oxidoreductase  33.73 
 
 		 325 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00306764  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5153  hopanoid-associated sugar epimerase  31.3 
 
 		 342 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.95 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1955  hypothetical protein  34.38 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.862729  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.61 
 
 		 273 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  25.82 
 
 		 223 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1613  hypothetical protein  28.74 
 
 		 342 aa  42  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.899214  normal  0.0629949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4583  Male sterility-like  28 
 
 		 282 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>