More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0324 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  74.82 
 
 
274 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  56.99 
 
 
274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  55.31 
 
 
273 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  55.23 
 
 
274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  49.08 
 
 
271 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  51.47 
 
 
280 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  44.12 
 
 
273 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  47.46 
 
 
276 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  42.12 
 
 
286 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  42.27 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  42.12 
 
 
584 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  38.3 
 
 
284 aa  171  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  40.85 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  42.07 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  40.29 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  41.61 
 
 
275 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  40.49 
 
 
280 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.36 
 
 
281 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  42.92 
 
 
240 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.56 
 
 
274 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  38.33 
 
 
272 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.92 
 
 
271 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.64 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  36.01 
 
 
279 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  35.09 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  36.84 
 
 
279 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  34.4 
 
 
280 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  38.43 
 
 
267 aa  135  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  38.81 
 
 
295 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  35.46 
 
 
283 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  33.33 
 
 
287 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  33.1 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  35.21 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  34.84 
 
 
292 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  37.86 
 
 
274 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  34.62 
 
 
281 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  37.19 
 
 
285 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.76 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  33.79 
 
 
281 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.29 
 
 
295 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.45 
 
 
310 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  36.32 
 
 
287 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.27 
 
 
288 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  35.14 
 
 
302 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  33.33 
 
 
282 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.62 
 
 
291 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.65 
 
 
299 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.63 
 
 
290 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  31.38 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.18 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.4 
 
 
277 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  32.76 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.63 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  34.97 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.93 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  35.4 
 
 
293 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  35.43 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.02 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  33.22 
 
 
295 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.67 
 
 
272 aa  92  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  34.67 
 
 
287 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  34.67 
 
 
287 aa  92  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  36.44 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.37 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  31.67 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.41 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.23 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  31.02 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  32.3 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  31.83 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  34.98 
 
 
293 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  32.57 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  34.21 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.42 
 
 
281 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  29.08 
 
 
434 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.09 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.93 
 
 
351 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  33.6 
 
 
283 aa  85.5  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  33.92 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.88 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.42 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.12 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  32.78 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  34.38 
 
 
291 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  30.55 
 
 
278 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  30.18 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  29.82 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  29.15 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6636  NmrA family protein  32.5 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2401  NmrA family protein  35.42 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242645  hitchhiker  0.000749924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  25.9 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  31.23 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2481  NmrA family protein  32.75 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  33.18 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.27 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  31 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  27.44 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  30.74 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>