275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2684 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  47.78 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  43.32 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  41.01 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  42.35 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  41.81 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  38.27 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  38.93 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  42.7 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  40.22 
 
 		 584 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  41.67 
 
 		 280 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  37.99 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  35.61 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  40.14 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.84 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.69 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  39.29 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  39.57 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  36.69 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  36.04 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  35.44 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  36.07 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  34.74 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  33.21 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  38.06 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.29 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  36.07 
 
 		 310 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  37.19 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  32.65 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  36.52 
 
 		 280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  36.2 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  33.68 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.21 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  32.75 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35.62 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.79 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.56 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.12 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.29 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  32.87 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  36.69 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  33.79 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  34.15 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  34.15 
 
 		 287 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.85 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.08 
 
 		 293 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  32.86 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  34.68 
 
 		 290 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  34.23 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.99 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.7 
 
 		 301 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.91 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.9 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  32.34 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.11 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.4 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  32.14 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.8 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.21 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  27.43 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.16 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  30.1 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.74 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.5 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  31.56 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.91 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.1 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  30.45 
 
 		 287 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  30.18 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3897  NmrA-like  29.86 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0125783  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.21 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.27 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  33.04 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  32.22 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1828  NmrA family protein  30.63 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.85 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  31.25 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0388  NmrA family protein  30.03 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.012562 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5084  NmrA family protein  28.88 
 
 		 294 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.53 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.7 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  26.26 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  29.49 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  29.35 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  32.49 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  27.67 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  29.69 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32.04 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  35 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  30.8 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  32 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  30.45 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  28.47 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.93 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  30.4 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  30.85 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.9 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>