More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3759 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  50.54 
 
 		 288 aa  295  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  40.07 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  34.77 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  33.93 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  31.23 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.77 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.42 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.54 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  29.64 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.53 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.9 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  30.38 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  29.75 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  30.04 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.43 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  29.14 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  29.14 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  29.43 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  29.14 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.73 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  30.66 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.67 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.21 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  25.61 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.82 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  28.78 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  28.36 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  26.79 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  26.69 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  29.89 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  26.79 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.33 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.82 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  30.82 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  29.25 
 
 		 286 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  28.62 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  28.62 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.11 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.66 
 
 		 584 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  28.62 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  27.72 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.87 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5651  NmrA family protein  32.74 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  31.51 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  26.6 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.67 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  28.27 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.72 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  25.62 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.1 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  28.27 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  28.93 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  29.58 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.72 
 
 		 283 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  25.54 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  33.33 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  29.37 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.43 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  27.44 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  30.56 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  24.63 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  28.17 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  29.29 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  28.77 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  26.47 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  28.97 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  29.23 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  29.79 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  29.23 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1716  NmrA family protein  28.47 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  30.07 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.51 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  31.05 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  31.05 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  27.31 
 
 		 290 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  30.1 
 
 		 283 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  23.1 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  26.64 
 
 		 285 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  27.52 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  29.33 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  28.42 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  27.46 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  23.25 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  31.96 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  26.74 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  26.33 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  28.71 
 
 		 207 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  26.84 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  27.56 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  28.31 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  27.65 
 
 		 287 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3810  NmrA family protein  28.51 
 
 		 284 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00082597  normal  0.691187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>