More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4702 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  50 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  47.06 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  48 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  44.95 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  46.76 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  44.44 
 
 		 291 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.61 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  43.11 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  46.26 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  41.43 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  44.93 
 
 		 276 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  41.61 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  39.3 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  41.43 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  35.87 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  41.79 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  39.19 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  39.08 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  38.71 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  37.09 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  40.38 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  45.29 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  45.29 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  46.77 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  41.94 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  38.81 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  37.63 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  38.43 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  44.78 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  37.05 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  37.41 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  37.41 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  36.17 
 
 		 434 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  33.7 
 
 		 351 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  37.91 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  35.62 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  34.66 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  38.13 
 
 		 291 aa  118  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.36 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  32.38 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  34.88 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.02 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  34.04 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  30.1 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.75 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  35.42 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  34.04 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  33.09 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  35.21 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.92 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  35.46 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  33.45 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  35.31 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.73 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  35.06 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  40.96 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.82 
 
 		 274 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  41.03 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.7 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  34.17 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  34.41 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  36.4 
 
 		 275 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  31.45 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.31 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  31.94 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.45 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  34.49 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  34.41 
 
 		 584 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.51 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  26.88 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.29 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.45 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  33.45 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  33.45 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.28 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  33.1 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  24.14 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  29.93 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35.36 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.07 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.27 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1166  hypothetical protein  30.5 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22916  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  36.44 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  26.12 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  33.22 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.21 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.18 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.96 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  33.45 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  31.86 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  28.52 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  27.21 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  28.82 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.2 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  31.34 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  28.93 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  29.53 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>