282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2341 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  100 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  65.81 
 
 		 276 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  57.99 
 
 		 294 aa  305  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  67.03 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  67.03 
 
 		 274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  58.82 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  54.61 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  57.89 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  54.31 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  53.68 
 
 		 291 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  48.72 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.25 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  46.84 
 
 		 276 aa  262  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  49.63 
 
 		 279 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  50 
 
 		 285 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  46.69 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.06 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  43.01 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  43.9 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  47.19 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  43.06 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  47.08 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  41.64 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  41.7 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  38.18 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  41.61 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  39.41 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  44.03 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  49.12 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  37.63 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  39.23 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  36.5 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  35.14 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  34.41 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  34.41 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  33.46 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  34.05 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  31.52 
 
 		 351 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.45 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  28.35 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  34.83 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  32.37 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  33.68 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  34.27 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  30 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  31.72 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  62.67 
 
 		 81 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.78 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  31.05 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  33.08 
 
 		 275 aa  92  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  33.04 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  31.72 
 
 		 294 aa  89.4  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  35.19 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  31.39 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.67 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  34.94 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.91 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.34 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.62 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  29.89 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.35 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.34 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  29.11 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  28.27 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  28.77 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.6 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  26.74 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  30.6 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  29.09 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.48 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  29.27 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  30.56 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  30.72 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  29.32 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  29.85 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  30.24 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  30.5 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  32.79 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  29.37 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.58 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  27.4 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  26.54 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  30.83 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  32.29 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  28.72 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  29.03 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  27.92 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.82 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.09 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  26.22 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  30.77 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  29.61 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  31.55 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  26.56 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  29.39 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  29.55 
 
 		 584 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  32.22 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>