More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0634 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  100 
 
 
279 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  80.25 
 
 
240 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  48.77 
 
 
281 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  50 
 
 
280 aa  232  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  49.46 
 
 
584 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  43.4 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  42.6 
 
 
274 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  41.81 
 
 
280 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.36 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  42.07 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  38.13 
 
 
273 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  38.87 
 
 
284 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  36.96 
 
 
273 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  38.49 
 
 
271 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  44.13 
 
 
275 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  41.33 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  39.08 
 
 
272 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  38.38 
 
 
268 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  40.28 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.5 
 
 
271 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  42.25 
 
 
279 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  39.65 
 
 
281 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  36.69 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.94 
 
 
279 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  33.1 
 
 
274 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  38.01 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  39.58 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  40.77 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  38.03 
 
 
269 aa  139  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  37.1 
 
 
279 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  38.08 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  36.36 
 
 
283 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  38.16 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  35.07 
 
 
296 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  37.5 
 
 
280 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  36.49 
 
 
282 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  35.86 
 
 
302 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  35.79 
 
 
276 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  35.44 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  38.2 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  36.96 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  35.54 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  34.12 
 
 
293 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.07 
 
 
273 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  35.64 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.02 
 
 
281 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  33.22 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  35.99 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  31.06 
 
 
288 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.08 
 
 
291 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  36.61 
 
 
290 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  36.16 
 
 
290 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  36.11 
 
 
281 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.19 
 
 
287 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  35.11 
 
 
298 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  32.13 
 
 
351 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  33.57 
 
 
276 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  35.59 
 
 
289 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  35.82 
 
 
291 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  34.05 
 
 
294 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  35.79 
 
 
281 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  34.14 
 
 
289 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  33.67 
 
 
301 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  29.86 
 
 
292 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  33.56 
 
 
288 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  35.38 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.45 
 
 
434 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  32.34 
 
 
293 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  34.15 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  35.84 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  34.13 
 
 
281 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  33.45 
 
 
304 aa  95.9  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  36.2 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  34.68 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  34.68 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  35.71 
 
 
287 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  31.53 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  29.47 
 
 
277 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  33.1 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  32.65 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  33.56 
 
 
309 aa  90.1  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  31.27 
 
 
281 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.51 
 
 
283 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.42 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  32.29 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  31.64 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  33.33 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  33.33 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  30.9 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  30.18 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  31.71 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  31.32 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  28.76 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  33.09 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  32.88 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  32.76 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.46 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  35.4 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  30.63 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>