More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4686 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  100 
 
 
274 aa  534  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  59.56 
 
 
274 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  56.99 
 
 
280 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  55.68 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  46.15 
 
 
273 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  47.99 
 
 
271 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  46.38 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  49.1 
 
 
276 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  49.45 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  43.88 
 
 
286 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  42.6 
 
 
279 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  42.96 
 
 
584 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  44.37 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  47.37 
 
 
240 aa  158  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  40.85 
 
 
284 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  41.4 
 
 
281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  38.06 
 
 
283 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  39.3 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.5 
 
 
281 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  40.7 
 
 
275 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  35.02 
 
 
274 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.89 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  37.28 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  36.62 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  33.68 
 
 
268 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  33.57 
 
 
279 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  39.79 
 
 
295 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  36.59 
 
 
269 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  34.84 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  34.68 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  34.48 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  35.29 
 
 
272 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.63 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  35.54 
 
 
274 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  37.45 
 
 
267 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  34.8 
 
 
285 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  34.24 
 
 
287 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  33.45 
 
 
288 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  35.31 
 
 
288 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  32.62 
 
 
290 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  30.61 
 
 
292 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  34.71 
 
 
281 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  31.69 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.47 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.86 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.98 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  31.51 
 
 
282 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  32.97 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.38 
 
 
434 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  35.16 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  34.71 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  31.41 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.41 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  33.95 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.42 
 
 
273 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  32.98 
 
 
284 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.53 
 
 
287 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.36 
 
 
287 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  32.26 
 
 
276 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.88 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  28.21 
 
 
292 aa  89  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  29.83 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  32.86 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  32.32 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  31.35 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  31.46 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  34.38 
 
 
278 aa  85.5  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  33.57 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  29.87 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  35.23 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.89 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0200  NmrA family protein  29.14 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.352919  normal  0.33471 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  29.97 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  29.97 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  33.05 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  32.08 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.39 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  27.42 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  38.07 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  31.08 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  29.74 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  32.41 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  29.86 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  33.58 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  30.04 
 
 
332 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.85 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.33 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  32.5 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  29.3 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  32.97 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  30.77 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  34.41 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  29.13 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  32.4 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  29.07 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  28.27 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  28.27 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  29.43 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.83 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>