More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0312 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  100 
 
 		 299 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  57.3 
 
 		 351 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  45 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  35.64 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  43.62 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  36.57 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  37.68 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  36.96 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  35.13 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  33.81 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  38.04 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  36.36 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  31.41 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  36.43 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  31.47 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  35.14 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  36 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  36 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  33.1 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  34.74 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  32.75 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.29 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.5 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  35.32 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  35.51 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  31.56 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  32.14 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  33.33 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.86 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.61 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  33.21 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  34.16 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  40 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  35.23 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.86 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  35.56 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  28.52 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  32.76 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  33.57 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  34.17 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.56 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.51 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  34.64 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  32.38 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  31.6 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  37.32 
 
 		 279 aa  109  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  35.71 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  36.43 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.93 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  33.45 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.98 
 
 		 584 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  32.53 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  39.91 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.08 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  34.07 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  33.58 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  33.6 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  33.82 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  34.39 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  34.39 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.39 
 
 		 287 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  34.05 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.6 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  33.21 
 
 		 287 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  32.64 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  32.01 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.25 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  33.45 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  24.73 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  32.75 
 
 		 279 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  33.8 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  33.56 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  35.13 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  33.68 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  35.71 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  32.01 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  34.11 
 
 		 280 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.35 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.33 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  29.82 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  32.87 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.43 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  35.06 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  35.1 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  34.57 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.09 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  29.14 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  33.06 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  32.13 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  31.11 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6067  NAD-dependent epimerase/dehydratase:NmrA-like  33.57 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.551699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2477  NmrA family protein  30.63 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  31.16 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  35.02 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  32.04 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  33.33 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  29.97 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  26.79 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.65 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>