291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6349 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  44.6 
 
 
351 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  45 
 
 
299 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  37.14 
 
 
276 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  34.04 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  31.07 
 
 
434 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  32.61 
 
 
281 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  33.81 
 
 
278 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  32.27 
 
 
287 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  32 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.37 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  29.86 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  29.82 
 
 
306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  30.22 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  32.61 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  32.61 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  32.61 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  31.73 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  30.28 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  31.77 
 
 
279 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  31.02 
 
 
279 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  31.65 
 
 
279 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.62 
 
 
294 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30 
 
 
584 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  31.25 
 
 
279 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.17 
 
 
294 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  29.06 
 
 
280 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  32.34 
 
 
276 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.57 
 
 
288 aa  99  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  26.95 
 
 
276 aa  98.6  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  29.76 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  27.12 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  31.99 
 
 
304 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  30.45 
 
 
285 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  32.38 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.6 
 
 
274 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.25 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  27.92 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.45 
 
 
291 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  32.85 
 
 
279 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  34.6 
 
 
278 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  27.72 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  29.72 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.53 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  26.16 
 
 
281 aa  89.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  29.41 
 
 
274 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  27.9 
 
 
285 aa  89  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  29.71 
 
 
291 aa  89  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  29.51 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  28.83 
 
 
281 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  26.39 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  29.01 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  25.71 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  32.46 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  26.91 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.53 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  26.43 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.22 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  33.09 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.16 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.72 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  29.47 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  27.86 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  29.54 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  31.83 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  27.56 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  32.37 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  32.37 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  27.78 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  27.68 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  27.34 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  26.86 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  27.59 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  26.43 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  29.86 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  25.63 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  31.39 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  28.83 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  29.2 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  28.87 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  26.55 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  26.96 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  28.27 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  28.18 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  25.17 
 
 
285 aa  72.4  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  27.08 
 
 
292 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  27.57 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  24.91 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  25.34 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  26.04 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  25.52 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  29.18 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  24.83 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  30.28 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  25.76 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.82 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  26.73 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  27.18 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  27.01 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>