240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3410 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  50.38 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  47.04 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  47.19 
 
 		 291 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  47.62 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  46.52 
 
 		 279 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  39.56 
 
 		 276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  43.38 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  41.54 
 
 		 279 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.42 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  42.69 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  43.01 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  38.91 
 
 		 272 aa  201  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  39.93 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  41.3 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  38.64 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  41.88 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  41.88 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  38.49 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  41.79 
 
 		 268 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  37.37 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  39.3 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  39.71 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  36.96 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  34.05 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  37.31 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  42.22 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  33.08 
 
 		 280 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  37.96 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.39 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  30.43 
 
 		 434 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  28.42 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.91 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  29.54 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  29.29 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  29.29 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.96 
 
 		 351 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  30.69 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  30.41 
 
 		 291 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.9 
 
 		 277 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  27.84 
 
 		 294 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  31.16 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  29.35 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  30.85 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.74 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  30.63 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  28.11 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  30.14 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  28.83 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  30.21 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  30.39 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  30.74 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  25 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.97 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  30.67 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  27.53 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  31.25 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  30.42 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  26.35 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.9 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  30.08 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  27.37 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  30.3 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  25.44 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  30.18 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  26.86 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  27.21 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  47.3 
 
 		 81 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  26.78 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  27.11 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  28.22 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  27.5 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  27.27 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  28.21 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  26.97 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  27.27 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  30.19 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  27.06 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  26.57 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  26.44 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  30.68 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  29.02 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  27.85 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  24.83 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  27.17 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1633  NmrA family protein  27.34 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  26.71 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  26.27 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  25.71 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  27.15 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  27.47 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  25.82 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  24.21 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  26.1 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>