More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3651 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  100 
 
 		 276 aa  538  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  50 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  50.9 
 
 		 273 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  49.46 
 
 		 274 aa  221  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  47.83 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  45.13 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  41.67 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  46.91 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  40.65 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  40.6 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  37.41 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  40.29 
 
 		 584 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  37.63 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  36.36 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  37.5 
 
 		 283 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  35.61 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  35.29 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  35.71 
 
 		 274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  33.8 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  34.14 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.06 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  37.89 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  35.66 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  33.99 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  35.42 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  37.89 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.75 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  36.27 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  38.62 
 
 		 275 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.42 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  37.56 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  34.45 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  32.49 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  34.6 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  35.86 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.72 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  35.89 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.87 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  34.39 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  33.81 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  31.14 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.94 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  30.43 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  34.19 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.2 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.74 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  32.04 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  31.41 
 
 		 285 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.17 
 
 		 278 aa  95.5  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  33.46 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  33.09 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  30.85 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  35.89 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  32.97 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.82 
 
 		 288 aa  89.4  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  30.93 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  30.93 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  31.82 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.24 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  30.24 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  34.45 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  32.62 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.86 
 
 		 277 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  31.38 
 
 		 284 aa  85.5  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  33.67 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  30.39 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  31.53 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  30.1 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  30.45 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  27.46 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  29.19 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  28.15 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  29.48 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  29.93 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  34.06 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  28.91 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  34.17 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  29.93 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  31.03 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.98 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  28.36 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  31.69 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  29.39 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  32.31 
 
 		 295 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  31.36 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.14 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.21 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  29.89 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.38 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  30.03 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  29.54 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  25.27 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  29.79 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.19 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  27.9 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2189  NmrA family protein  32.03 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00531075  normal  0.451733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.15 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>