253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3545 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3545  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 276 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.789815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0902  NmrA family protein  54.24 
 
 		 294 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  54.78 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2997  NmrA family protein  52.88 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  54.1 
 
 		 278 aa  261  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1700  NmrA family protein  44.98 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3216  NmrA family protein  51.29 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4824  NmrA family protein  41.7 
 
 		 276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2341  NmrA-like  47.06 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6882  NmrA-like  49.82 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1674  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.49 
 
 		 279 aa  224  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.117563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1525  NmrA family protein  45.15 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000360309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0136  NmrA family protein  45.05 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3410  NmrA-like  41.79 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.630504  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1006  NmrA family protein  42.65 
 
 		 272 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  45.53 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1550  NmrA-like  50.55 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6279  NmrA family protein  50.55 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2345  NmrA family protein  49.25 
 
 		 268 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.895981  normal  0.0493996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  42.03 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5735  NmrA family protein  46.1 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  39.43 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  37.41 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  41.45 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  37.76 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  40.21 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2405  NmrA family protein  49.3 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1515  NmrA family protein  44.03 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  36.13 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  36.03 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  35.69 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3007  NmrA-like protein  36.13 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3053  NmrA family protein  36.13 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  33.1 
 
 		 434 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4020  hypothetical protein  35.17 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  34.76 
 
 		 304 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3383  NmrA family protein  36.36 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  33.21 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.963231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3754  NmrA family protein  41.46 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00869752  normal  0.872843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  32.31 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0806  hypothetical protein  33.92 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  28.62 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  33.78 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  29.52 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  32.04 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  36.5 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  29.26 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  26.79 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  31.54 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  32.76 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  32.27 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  32.5 
 
 		 584 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1347  NmrA family protein  32.71 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142446  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  33.21 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  32.86 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  28.37 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.96 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  32.98 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2993  NmrA family protein  28.08 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0106693  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  31.85 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  27.41 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.03 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  31.18 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  29.37 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  31.23 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  23.13 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  29.35 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  31.14 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  29.04 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0093  NmrA-like protein  29.04 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.409257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  29.75 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1894  NmrA family protein  33.08 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.850612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  34.55 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  29.14 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1068  NmrA family protein  31.28 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.746478  normal  0.218784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  28.62 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  25.5 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  26.62 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  29.82 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  31.5 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  29.02 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1852  NmrA family protein  32.91 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  34.16 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  31.45 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  29 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  29.78 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  26.91 
 
 		 274 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6771  NmrA-like protein  41.77 
 
 		 81 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  28.96 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  35.86 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  32.72 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  35.04 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  28.42 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  25.45 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  28.47 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  27.72 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  23.26 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>