More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1235 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1235  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  44.68 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3559  NmrA family protein  44.68 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5612  NmrA family protein  41.46 
 
 		 287 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal  0.705439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4300  NmrA family protein  41.58 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  41.28 
 
 		 584 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5449  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  37.37 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  normal  0.101659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1360  NmrA family protein  41.07 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  37.32 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  41.7 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1339  NmrA family protein  37.06 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1213  NmrA family protein  36.97 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423436  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  35.56 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4673  NmrA family protein  37.15 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.909291  normal  0.648206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5325  NmrA family protein  37.84 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.558765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0324  NmrA family protein  38.33 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3339  NmrA family protein  35.82 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7958  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  36.33 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3651  NmrA family protein  35.42 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1958  NmrA family protein  33.33 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.190624  normal  0.373159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0660  NmrA family protein  42.34 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1449  NmrA family protein  38.35 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5627  NmrA family protein  33.45 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0272  NmrA family protein  33.1 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4894  NmrA family protein  39.24 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  36.65 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4686  NmrA family protein  35.29 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2660  NmrA family protein  32.51 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6522  NmrA family protein  34.97 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114988  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4166  nucleotide-diphosphate-sugar epimerase  32.52 
 
 		 281 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6001  NmrA family protein  34.93 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0281153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6618  NmrA family protein  34.28 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1963  NmrA family protein  32.19 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145776 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.38 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.47 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6339  NmrA family protein  33.78 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7197  NmrA family protein  31.87 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  36.64 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0911  NmrA family protein  33.21 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2684  NmrA family protein  35.69 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.66579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0312  NmrA family protein  31.64 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.212335  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2046  NmrA family protein  33.57 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  26.82 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2493  NmrA family protein  32.04 
 
 		 288 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6340  NmrA family protein  33.63 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  30.04 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6187  NmrA family protein  29.31 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  27.68 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4033  NmrA family protein  34.08 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.027293  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  30.14 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0547  NmrA family protein  34.98 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  27.4 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4330  NmrA family protein  29.76 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1673  NmrA family protein  34.08 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  34.08 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6266  NmrA family protein  34.08 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0469029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1991  NmrA family protein  33.63 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6433  NmrA-like  33.63 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6668  NmrA family protein  33.63 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0183081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  29.56 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2210  NmrA family protein  29.93 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4112  NmrA family protein  31.08 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8402  NmrA family protein  30.6 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  32.8 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9342  hypothetical protein  30.4 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4838  NmrA family protein  31.06 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00518193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  25.91 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8682  NmrA family protein  30.33 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  28.73 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6349  NmrA family protein  26.96 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0576  hypothetical protein  28.22 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0403  NmrA family protein  31.37 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  26.48 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  31.56 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  25.71 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  25.62 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.141681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  27.74 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2536  NmrA family protein  26.94 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3020  hypothetical protein  32.88 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375622  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.19 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3022  NmrA family protein  29.75 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.589818  normal  0.26374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4454  NmrA family protein  30.83 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6198  NmrA family protein  28.25 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1244  NmrA family protein  27.31 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0114092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6212  NmrA family protein  34.05 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2984  NmrA family protein  29.86 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.238813  hitchhiker  0.00344472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.9 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2435  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.64 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4702  NmrA family protein  31.95 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  30.25 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.65 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  27.05 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>