More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3950 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  100 
 
 		 286 aa  569  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  70.5 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  58.55 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  52.54 
 
 		 288 aa  261  8e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  52.48 
 
 		 304 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  53.65 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  51.24 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  48.54 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  48.2 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  50.53 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  49.16 
 
 		 358 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  35.82 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  39.22 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  37.27 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  32.99 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  37.68 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  28.03 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  30.9 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  33.75 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  30.87 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  32.92 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.89 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  31.1 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  36 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.86 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  32.14 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  30.25 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.22 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  34.74 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  36.7 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  32.49 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  32.16 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  33.68 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  33.68 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  34.75 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  30.74 
 
 		 287 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.74 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  33.33 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  33.33 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  29.54 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  31.77 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  30.71 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  33.33 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  33.33 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4346  NmrA family protein  30.1 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  35.29 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  31.77 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.33 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  32.18 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  34.4 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  32.98 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  34.49 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6079  NmrA family protein  31.63 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.105085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  30.77 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  32.98 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  32.59 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  31.25 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  35.37 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2693  NmrA family protein  27.54 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3071  NmrA family protein  32.03 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  35.44 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  29.39 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  32.48 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  30.26 
 
 		 301 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  37.23 
 
 		 303 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5809  NmrA family protein  33.68 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  33.05 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  38.08 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  32.73 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  32.21 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  34.21 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  35.56 
 
 		 290 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  34.18 
 
 		 285 aa  90.1  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  32.72 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  25.18 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  36.96 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  29.5 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  32.86 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  34.51 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  32.85 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  26.76 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3759  NmrA family protein  24.47 
 
 		 292 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.791935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  30.37 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  30.18 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  30.37 
 
 		 282 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  35.11 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  30.77 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  35.65 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  35.65 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5261  NmrA family protein  29.57 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  31.6 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1710  NmrA family protein  30.08 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  35.19 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  30 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  30.37 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  30.37 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22520  hypothetical protein  29.39 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000139034  hitchhiker  0.0000222268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>