More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4578 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  55.87 
 
 		 282 aa  289  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  57.71 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  55.07 
 
 		 286 aa  273  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  57.25 
 
 		 276 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  52.98 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  55.12 
 
 		 301 aa  241  7e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  50.36 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  48.95 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  44.57 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  49.16 
 
 		 358 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  38.7 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  36.43 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  31.29 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  37.29 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  37.5 
 
 		 284 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  29.97 
 
 		 288 aa  122  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  36.93 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  38.16 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  36.97 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  37.39 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  33.44 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  37.41 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  31.58 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  36.12 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  35.46 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  35.71 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  36.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  36.92 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2181  NmrA family protein  32.75 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  34.4 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  33.45 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  34.8 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  34.8 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  33.92 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  33.63 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  39.06 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  37.05 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  33.92 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  33.92 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  35.02 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  30.6 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  33.48 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  33.45 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  33.48 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  33.48 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  33.48 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.66 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  37.19 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.63 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  39.15 
 
 		 282 aa  99.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  30.6 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  34.66 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05352  hypothetical protein  33.45 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  0.976104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  39.37 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0037  NmrA family protein  35.96 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  0.162843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  31.99 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  36 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  30.36 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  33.94 
 
 		 288 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  33.21 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  34.8 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  35.92 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.63 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  26.78 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  37.17 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  34.72 
 
 		 280 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  30.1 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  28.93 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6179  NmrA family protein  32.08 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0550335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2930  NmrA family protein  35.19 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2511  NmrA family protein  35.29 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0182  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.17 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  32.14 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4150  NmrA family protein  33.81 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515383  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  36.52 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  33.19 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2152  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  31.32 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  32.6 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  32.49 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2044  NmrA family protein  32.16 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  32.6 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.93 
 
 		 282 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1768  hypothetical protein  27.68 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0235  NmrA family protein  33.47 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.19532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  33.48 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  35.07 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  27.24 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0634  NmrA family protein  33.45 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.196658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.44 
 
 		 287 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  31.11 
 
 		 283 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1079  NmrA family protein  29.61 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0344  NmrA family protein  31.18 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>